Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Clec18aQ7TSQ1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms