Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccp110Q7TSH4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms