Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prrc2aQ7TSC1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prrc2aQ7TSC1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms