Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shq1Q7TMX5 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shq1Q7TMX5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms