Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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