Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim12Q78RX3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim12Q78RX3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim12Q78RX3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim12Q78RX3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Smim12Q78RX3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms