Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rph3alQ768S4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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