Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnih3Q6ZWS4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cnih3Q6ZWS4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnih3Q6ZWS4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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