Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms