Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim37Q6PCX9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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