Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slf2Q6P9P0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slf2Q6P9P0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms