Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Usp49Q6P9L4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp49Q6P9L4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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