Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tpm4Q6IRU2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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