Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms