Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atg9bQ6EBV9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg9bQ6EBV9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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