Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdzrn3Q69ZS0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzrn3Q69ZS0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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