Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Jmjd1cQ69ZK6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Jmjd1cQ69ZK6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms