Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc18Q640L5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc18Q640L5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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