Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a5Q63ZW6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a5Q63ZW6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms