Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms