Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms