Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tcf4Q60722 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcf4Q60722 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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