Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tnfsf15Q5UBV8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms