Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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