Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms