Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

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Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf20Q5DTM8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf20Q5DTM8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rnf20Q5DTM8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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