Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rtl6Q505G4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rtl6Q505G4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rtl6Q505G4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rtl6Q505G4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms