Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdp2Q504M2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdp2Q504M2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdp2Q504M2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdp2Q504M2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms