Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5935Q497S0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms