Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pacs2Q3V3Q7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms