Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ulk4Q3V129 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms