Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms