Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kdm5aQ3UXZ9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms