Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Znf48Q3US17 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms