Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Acsf3Q3URE1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms