Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms