Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms