Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm648Q3UJ22 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm648Q3UJ22 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm648Q3UJ22 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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