Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf224Q3UIW8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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