Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms