Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll12Q3UDE2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll12Q3UDE2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms