Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf180Q3U827 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms