Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trappc9Q3U0M1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms