Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Shcbp1lQ3TTP0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shcbp1lQ3TTP0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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