Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp39Q3TIX9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Usp39Q3TIX9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms