Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hddc2Q3SXD3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hddc2Q3SXD3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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