Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrna5Q2MKA5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrna5Q2MKA5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms