Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrp1aQ2LKU9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms