Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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ptchd1Q14B62 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ptchd1Q14B62 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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ptchd1Q14B62 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ptchd1Q14B62 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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