Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rpusd3Q14AI6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rpusd3Q14AI6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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